Фамилия Кайдин — один из тех случаев, где за одним звучанием стоят две совершенно разные версии происхождения, и обе имеют право на существование. Выбор между ними зависит от того, в какой среде и в какой местности фамилия закрепилась у конкретной семьи.

Первая и наиболее распространённая версия выводит фамилию из украинской или южнорусской среды. В её основе лежит слово «кайдани» — так называли кандалы, железные оковы для ног или рук. От этого слова образовалось прозвище Кайда. Чаще всего так могли прозвать кузнеца, который эти кандалы ковал, или же тюремного надзирателя, который их надевал. В обоих случаях фамилия относится к числу «профессиональных» прозвищ: она прямо указывала на ремесло или должность человека. Суффикс -ин в фамилии Кайдин — типичный русский патронимический суффикс, отвечающий на вопрос «чей?». Он означает «сын Кайды» или «человек из рода Кайды». Такая модель образования (прозвище + -ин) характерна для центральных и северных областей России, где фамилии на -ин так же привычны, как на -ов на юге и востоке.

Вторая гипотеза выводит фамилию из тюркского корня. В некоторых тюркских языках, в частности в турецком, слово «kayde» означает «летний дождь». Согласно этой версии, Кайда — не прозвище, а мирское имя, которое родители давали ребёнку, родившемуся в тёплый дождливый день. Такая практика давать имена по природным явлениям была широко распространена у тюркских народов. Если принять эту версию, то фамилия Кайдин — это русифицированная форма тюркского имени, к которому добавили русский суффикс принадлежности. Сторонники этой гипотезы считают её более правдоподобной для тех регионов, где русское и тюркское население веками жило рядом — например, в Поволжье, Приуралье или на юге Сибири.

Интересная деталь: фамилия Кайдин встречается заметно реже, чем её «двойник» Кайданов. Форма на -ов (Кайданов) обычно указывает на более позднее оформление фамилии в официальных документах, тогда как форма на -ин (Кайдин) могла закрепиться раньше, ещё в устной традиции, где было достаточно сказать «Иван Кайдин сын». Сравнение этих двух фамилий — Кайдин и Кайданов — может помочь историкам семьи понять, в какой именно период и в каком сословии фамилия была зафиксирована.