Фамилия Кайхан образована от двух тюркских слов: «кай» и «хан». Первое из них переводится на русский язык как «правитель», а второе — «некоторый, иной». Возможно также, что фамилия Кайхан ведет свое начало от мужского имени Кайхан, которое имеет значение «хан Кайского племени». Известно, что это имя сохранилось у татар-мишарей (мещеряков) в фамилии Кайханов.