Она образована от тюркского личного имени Кайдан, которое в переводе означает «связанный». Однако нельзя исключить связь этого имени и с турецким словом kayde - «летний дождь». В украинском языке есть родственное слово «кайдани» - «кандалы», также пришедшее из тюркских языков. Поэтому нельзя исключить, что в основе фамилии Кайдан лежит прозвище, которое мог носить крепостной крестьянин, несвободный человек.