Фамилия Кайдан в большинстве случаев ведет происхождение от тюркского личного имени Кайдан. В переводе с тюркских языков это имя означает «связанный». Скорее всего, в основе лежит именно этот антропоним, а не нарицательное слово: в прошлом имя давали ребенку, чтобы символически «привязать» его к роду или дому, защитить от злых сил. Такая практика была распространена у многих тюркских народов.

Впрочем, у исследователей есть и другие версии. Турецкое слово kayde переводится как «летний дождь» — возможно, прозвище Кайдан мог получить человек, родившийся в сезон дождей. Однако эта гипотеза выглядит менее убедительной: связь с личным именем встречается в источниках чаще.

Нельзя обойти стороной и созвучие с украинским словом «кайдани» — «кандалы», которое пришло в славянские языки из тюркских. Отсюда возникает версия, что фамилию могли дать как прозвище крепостному крестьянину или несвободному человеку. Но здесь важно понимать: в фамилиях на -ан редко закрепляется нарицательное значение в прямом уничижительном смысле. Скорее, если такая связь и была, прозвище носило ситуативный или ироничный характер.

Суффикс -ан в русских и украинских фамилиях не является типичным патронимическим окончанием (как -ов или -ин). Он чаще встречается в украинской и польской традиции, где мог оформлять прозвища или имена без дополнительных суффиксов. Это косвенно указывает на западные или южные корни фамилии.

Таким образом, наиболее вероятно, что фамилия Кайдан восходит к личному имени из тюркского наследия, а не к прозвищу «кандальник» или «дождь». Вторую версию — про несвободу — стоит рассматривать как возможную, но менее обоснованную.