Фамилия Каймаканов — один из тех случаев, когда в основе лежит не имя, а прозвище или должность, причем с явным тюркским следом. Корень здесь — «каймак». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском, киргизском) каймак — это пенка, снятая с топленого молока, или густые сливки, почти масло. Слово знакомо и в русских говорах юга и Поволжья, но в фамилию оно попало, скорее всего, через тюркскую среду.

Суффикс «-ан» в основе — характерный тюркский аффикс, образующий имя деятеля или прилагательное. «Каймакан» в таком случае — это человек, имеющий отношение к каймаку: либо тот, кто его делает, либо любитель полакомиться, либо прозвище по цвету или консистенции (например, белый, мягкий). Версия с должностью менее вероятна, но стоит упомянуть: в Османской империи «каймакам» — это наместник, заместитель губернатора. Однако у русских и поволжских татар это слово в таком значении не прижилось, поэтому для фамилии Каймаканов связь с административной должностью — натяжка. Правдоподобнее бытовое прозвище.

Фамилия образована по русской патронимической модели: к тюркской основе «Каймакан» добавили русский суффикс «-ов», означающий принадлежность («чей?» — сын Каймакана). Такая гибридная форма типична для XVI–XIX веков, когда тюркские прозвища и имена «русифицировали», делая их фамилиями. Встречается Каймаканов в основном в регионах с сильным татарским и башкирским влиянием — в Оренбургской, Челябинской областях, в Татарстане и Башкортостане.

Редкий случай — вариант с ударением. В русском языке ударение обычно падает на третий слог (Каймака́нов), что соответствует модели отыменных фамилий на «-анов». Но в тюркской среде основа «кайма́к» (с ударением на второй слог) могла дать и фамилию Кайма́канов, хотя в документах закрепился первый вариант. Если вы встретили носителя с другим ударением — это не ошибка, а региональная особенность.

Сравните с однокоренными: Каймаков (от «каймак» напрямую), Кайманов (от «кайман» — крокодил, но это совсем другая история). Каймаканов стоит особняком из-за двойного суффикса — сначала тюркского, потом русского. Таких фамилий немного, и они ценны для ономастики именно как пример культурного смешения.