Фамилия Каюдин — одна из тех, где за короткой основой стоит сразу несколько версий, и каждая по-своему объясняет, кем мог быть предок. Самое прямое объяснение ведёт к прозвищу Каюда, которое связано с глаголом «каючить» — то есть рыбачить на каюке или каючке. Каючок, в свою очередь, это небольшая лодка с плоским дном и двумя вёслами, распространённая на малых реках. Слово пришло в русский язык из тюркских языков: турецкое kaik — «лодка, баржа, челн» или татарское kajuk — «небольшая лодочка». Значит, первый носитель прозвища Каюда с большой вероятностью был рыбаком или перевозчиком, чья работа была неразрывно связана с этой лодкой.

Суффикс -ин в фамилии Каюдин указывает на принадлежность: «чей?» — Каюдин, то есть сын или потомок Каюды. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я. Здесь основа Каюд- (от Каюда) легко ложится в эту схему, и фамилия закрепилась в формах на -ин, а не на -ов, что дополнительно подтверждает её прозвищное происхождение.

Есть и альтернативная версия, хотя она менее убедительна с точки зрения бытовой логики. Согласно ей, прозвище Каюда восходит к татарскому слову гәудә — «туловище, тело, корпус, стан». Если следовать этому толкованию, прозвище могли дать человеку с красивым, подтянутым телосложением. Но здесь возникает вопрос: насколько такое прозвище было бы употребительным в русской среде? Тюркские заимствования в русских говорах чаще касались предметов быта, ремёсел и промыслов, а не описания внешности. Поэтому версия с рыбаком на каючке выглядит естественнее и лучше объясняет, почему прозвище вообще возникло и закрепилось.

Географически фамилия Каюдин встречается нечасто, но её можно встретить в Поволжье и на Урале — регионах, где были развиты речные промыслы и где тюркское влияние на местные говоры ощущалось сильнее. Это косвенно подтверждает «рыбацкую» версию: именно в таких местах слово «каюк» или «каючок» было в ходу, а прозвище Каюда — понятным окружающим.

Таким образом, потомок человека по прозвищу Каюда со временем стал Каюдиным. Фамилия недвусмысленно указывает на занятие предка: он был человеком реки, лодки и рыбы.