Фамилия Казачухина — женская форма фамилии Казачухин. Она происходит от мужского прозвища или нецерковного имени Казачуха. Основа здесь — слово «казак», но не в привычном значении «вольный воин». В русских говорах, особенно южнорусских и украинских, суффикс -ух-/-юх- придавал слову оттенок пренебрежения, насмешки или просто указывал на человека, тесно связанного с чем-то. Казачухой в XIX веке могли назвать не самого казака, а, например, батрака, наёмного работника у казаков, или человека, который «казакует» — то есть подражает казакам, носит похожую одежду, ведёт себя развязно. В словаре Владимира Даля зафиксировано слово «казаковатый» — с замашками казака. Так что прозвище могло быть как нейтральным («казачий человек»), так и ироничным («выдаёт себя за казака»).

Суффикс -ин- в фамилии Казачухин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Казачухи, потомок Казачухи. Это типичная модель для северных и центральных регионов России, где фамилии на -ин столь же распространены, как на -ов/-ев. Интересно, что сама основа Казачуха — редкая: в отличие от массовых Казаковых или Казаченко, она сохранила уменьшительно-пренебрежительный суффикс, который редко становился фамильным. Это позволяет предположить, что фамилия могла возникнуть не в среде запорожских или донских казаков, а среди крестьян или мещан тех областей, где казачество было не сословием, а скорее бытовым понятием — например, в Курской, Воронежской или Тамбовской губерниях.

Географически фамилия Казачухин (и Казачухина) встречается спорадически, без ярко выраженного гнезда. По данным современных телефонных справочников и баз, носители живут в Поволжье, на Урале и в Сибири — что типично для фамилий, вынесенных миграцией XIX–XX веков из чернозёмных губерний. В дореволюционных метрических книгах фамилия изредка фиксируется в Рязанской и Тамбовской губерниях, что косвенно подтверждает версию о крестьянском происхождении: именно оттуда шёл основной поток переселенцев на восток.

Есть и альтернативная версия, но слабая: связь с тюркским словом «казы» (колбаса из конины) или «казык» (кол). Она не выдерживает критики, поскольку суффикс -чух- не характерен для тюркских заимствований в русских фамилиях, а основа «казак» лежит на поверхности и не требует привлечения экзотических гипотез. Таким образом, Казачухина — фамилия, которая в исходной мужской форме звучала как насмешливое или бытовое прозвище: «казаковатый парень» или «работник при казаках». Со временем прозвище закрепилось за родом, и теперь оно — редкий памятник живой народной речи, где казак мог быть не героем, а просто соседом.