Фамилия Хабарухин — редкий образец русской фамилии, образованной не от полного крестильного имени, а от прозвища или мирского имени. Её основа — слово «хабар» или «хабара». В старых русских говорах и в языке промысловых людей (особенно сибирских) «хабар» означал прибыль, добычу, удачу, барыш. Отсюда же пошло слово «хабарщина» — взятка, мздоимство. Прозвище Хабар, Хабарок, Хабаруха давали человеку удачливому, умеющему добыть выгоду, либо, в ироничном ключе, тому, кто постоянно ищет лёгкой наживы.

Суффикс -ух- в основе (Хабарух-а) — это характерный для русских прозвищ и фамилий увеличительный или пренебрежительный формант, как в словах «воруха», «злодейка». Он подчёркивает, что прозвище было дано не просто так, а с яркой эмоциональной окраской. Фамилия оформилась по стандартной модели: к прозвищу Хабаруха добавился притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — «сын Хабарухи».

Интересно, что фамилия Хабарухин, скорее всего, имеет северное или сибирское происхождение. Слово «хабар» в значении «барыш» активно бытовало в среде промышленников и купцов, осваивавших Сибирь в XVII–XVIII веках. Известен, например, знаменитый Ерофей Хабаров, чья фамилия имеет тот же корень. Хабарухин — не столько «сын человека по имени Хабар», сколько потомок того, кого в своё время прозвали за характер или занятие «Хабарухой».

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли образовываться от любых основ, фамилии на -ин чаще фиксируют прозвища, оканчивающиеся на -а или -я. Поэтому Хабарухин — не «сын Хабара», а именно «сын Хабарухи», что делает фамилию более живой и конкретной, несущей отпечаток прямой речи предка. Сегодня эта фамилия встречается крайне редко, что делает её ценной для тех, кто изучает историю своей семьи: носитель Хабарухин почти наверняка происходит из небольшого круга родов, сохранивших диалектное слово в своей основе.