Фамилия Хабурин — редкий случай, когда прозвище могло быть образовано от названия не самого распространенного ремесла или орудия труда. Основа «хабур» в русских говорах имела несколько значений, и чтобы понять, какое из них легло в фамилию, стоит присмотреться к географии и словообразованию.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хабурин — «сын Хабуры» или «человек из семьи Хабуры». Само слово «хабура» в диалектах означало либо «мелкий торговец, перекупщик» (от тюркского «хабур» — весть, известие, но в переносном смысле — человек, который «носит вести»), либо, что более вероятно, «небольшую рыболовную снасть, мережу» или «корзинку для рыбы». Второе значение встречается в северных и волжских говорах, где рыболовство было основным промыслом. Прозвище Хабура могли дать рыбаку, который плел или чинил такие снасти, либо торговцу рыбой, использующему эту тару.

Менее правдоподобна, но возможна версия от тюркского имени Хабур (вариант арабского Хабир — «знающий», «сведущий»). Однако фамилия на -ин с такой основой чаще встречается в русской, а не татарской среде, где преобладали бы формы на -ов. Поэтому версия с прозвищем по занятию выглядит основательнее.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Основные очаги — исторические территории Нижегородской и Костромской губерний, где и фиксировались говоры со словом «хабура» в значении «рыболовная снасть». Носители фамилии, вероятно, происходили из крестьян-рыболовов или мелких ремесленников, обслуживающих промысел. В дворянских родословных книгах Хабурины не значатся — фамилия осталась в простонародной среде.

Однокоренных фамилий практически нет, что подтверждает редкость исходного прозвища. Встречается вариант написания Хобурин (с «о» в первом слоге, под влиянием аканья), но основная форма закрепилась с буквой «а».