Фамилия Ханафин — яркий пример того, как в русской фамилии сохранилось имя или прозвище, уходящее корнями в арабскую культуру. Её основа — мужское личное имя Ханафи. В арабском языке оно означает «правоверный», «приверженец истинной веры» или «последователь ханафитского мазхаба» (одного из четырёх правовых толков в исламе). Имя это было распространено среди народов, исповедующих ислам, особенно у татар и башкир, которые веками жили в тесном контакте с русским населением.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: к основе Ханаф- (усечённый вариант имени) добавили русский патронимический суффикс -ин. Этот суффикс в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Ханафи». Таким образом, Ханафин буквально означает «потомок человека по имени Ханафи». Фамилия образована по той же схеме, что и, например, Ильин (от Илья) или Никитин (от Никита), только исходное имя — восточное.

Географически фамилия Ханафин чаще всего встречается в регионах с традиционно сильным татарским и башкирским населением: в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской, Челябинской и Тюменской областях. Это говорит о том, что предки носителей фамилии, скорее всего, были татарами или башкирами, принявшими русскую фамильную модель в XVIII–XIX веках, когда у этих народов начали массово фиксировать фамилии по отчеству.

Интересно, что фамилия могла закрепиться и за человеком, который не звался Ханафи, а получил прозвище Ханаф за свою набожность или приверженность ханафитскому мазхабу. В таком случае прозвище переходило в фамилию по тому же правилу. Встречаются также варианты написания с двойной «н» — Ханнафин, но это скорее исключение, чем правило.

В отличие от многих фамилий с прозрачной славянской этимологией, Ханафин — свидетельство многовекового культурного обмена на стыке русского и тюрко-мусульманского миров. Она не несёт в себе указания на ремесло или сословие, но зато прямо говорит о вероисповедании и мировоззрении предка.