Фамилия Харчепко — один из тех случаев, когда написание сбивает с толку. На слух она почти неотличима от распространённой украинской фамилии Харченко, но разница в одной букве — «п» вместо «н» — меняет всю историю происхождения. Если Харченко почти всегда ведут род от личного имени Харитон (в просторечии Харько), то Харчепко — фамилия, скорее всего, прозвищная, и её корень лежит в бытовой сфере.

Основа «харч» в восточнославянских говорах означает «еда, продовольствие, провизия». Отсюда и «харчевать» — кормить, снабжать пищей. Человек, получивший прозвище Харч или Харчеп, мог быть либо кормильцем — щедрым хозяином, либо, наоборот, тем, кто заботился о провианте в артели или на промысле. Вполне вероятно, что предок носителя фамилии занимался поставкой продуктов или держал харчевню — заведение, где кормили проезжих.

Формант «-ко» — типичный уменьшительный суффикс в украинской и белорусской антропонимии, который со временем закрепился в фамилиях. Он указывает на южное или западное происхождение: фамилия явно сформировалась на территории современной Украины или юга России, в зоне влияния украинского языка. Модель образования простая: к прозвищу Харчеп (или Харч) добавили патронимический суффикс, и получилось «сын Харчепа» — Харчепко.

Стоит оговориться: не исключена и более редкая версия, при которой «Харчеп» — это искажённое, диалектное произношение имени Харлампий (в просторечии Харлам, Харламп). Но в отличие от Харченко, где связь с Харитоном бесспорна, для Харчепко эта гипотеза слабее: переход «м» в «п» на стыке корня нехарактерен, а вот связь с «харчами» лежит на поверхности и подтверждается множеством однокоренных фамилий — Харчев, Харчевин, Харчук.

В письменных источниках фамилия встречается редко, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, она не вышла за пределы небольшого региона или одной крестьянской общины. По сословной принадлежности предки, вероятнее всего, были казаками или государственными крестьянами, а фамилия закрепилась за потомками человека, чья связь с пропитанием и столом была заметна окружающим.