Фамилия Харена — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она имеет не славянские, а иноязычные корни, и её появление в русском языке связано с адаптацией чужого прозвища или имени.

Самая вероятная версия связывает фамилию с грузинским или другим кавказским именем Харена. В Грузии, например, существует имя Харена (женское) и фамилии, образованные от него с помощью суффикса -дзе или -швили. Однако в русской среде фамилия могла «потерять» типичный грузинский суффикс и закрепиться в усечённой форме — Харена. В таком случае она означает «потомок Харены» или просто «принадлежащий Харене». Второй вариант — это русификация фамилии, оканчивающейся на -а, что характерно для многих заимствованных фамилий на юге России и Кубани, где исторически были сильны контакты с кавказскими народами.

Менее вероятно, но возможно, что фамилия восходит к прозвищу. В некоторых говорах «харя» — лицо, морда, но вряд ли это легло в основу фамилии напрямую. Скорее, это могла быть ироничная или описательная кличка, но без письменных источников это только догадка.

Фамилия Харена не встречается в старых боярских списках или ревизских сказках центральной России. Её география — южные регионы, Краснодарский и Ставропольский края, Ростовская область, а также Закавказье и территории, где жили греки и другие народы Причерноморья. Встречается она и у ассирийцев (айсоров), у которых есть мужское имя Харена. Таким образом, предки носителя фамилии могли быть переселенцами с Кавказа, греками-понтийцами или представителями других малых народов, чьи имена и прозвища были адаптированы в русской среде.

Если коротко: фамилия Харена — почти наверняка нерусская по происхождению. Она либо усечённая форма грузинской фамилии, либо русифицированное личное имя. Искать её корни стоит в южных и кавказских регионах, а не в древнерусских писцовых книгах.