Фамилия Харитоно — яркий пример того, как региональные особенности русского языка закрепились в фамильном имени. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов (-ев) или -ин, эта фамилия имеет окончание -о, что сразу указывает на её украинское или южнорусское происхождение. В украинском языке фамилии нередко оформлялись без суффикса, просто добавляя окончание -о к основе имени. Так и здесь: в основе лежит каноническое мужское имя Харитон (от греческого «харис» — милость, благодать), а окончание -о выполняет роль притяжательного суффикса, отвечая на вопрос «чей?» — Харитонов сын, сокращённо Харитоно.

Такая модель образования типична для Левобережной Украины, особенно для Черниговской и Полтавской губерний, а также для южных областей России, куда переселялись украинские крестьяне. Фамилии вроде Харитоно, Данило, Петро, Кирило фиксируют живую народную речь, где имя отца переходило в фамилию без дополнительных суффиксов, в отличие от великорусской традиции с её обязательным -ов.

Интересно, что в официальных документах XIX века такую фамилию могли записать и по-русски — Харитонов, если чиновник «исправлял» написание на привычный лад. Поэтому среди носителей фамилии Харитоно часто встречаются родственники с фамилией Харитонов, что говорит о разной фиксации одной и той же родовой основы. С точки зрения сословной принадлежности, предки Харитоно почти наверняка были крестьянами или казаками — именно в этих средах украинская модель фамилий на -о держалась дольше всего.

Таким образом, фамилия Харитоно — не просто производное от имени, а маркер определённой региональной традиции именования, сохранившаяся в том виде, в каком её произносили в украинской среде.