Фамилия Харлукова звучит необычно, и её происхождение — не самый очевидный случай. В основе, скорее всего, лежит крестильное имя, но с интересным фонетическим изменением.

Исходная форма — Харлук. Это вариант канонического имени Харлампий (в просторечии — Харлам, Харламп). Имя греческого происхождения, означающее «сияющий радостью». В русской народной среде длинные и редкие церковные имена часто сокращали и переиначивали на свой лад: так Харлампий превращался в Харлама, а затем — в Харлука. Суффикс -ук здесь указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму, характерную для южных и западных русских говоров, а также для украинского и белорусского языков. Таким образом, Харлук — это «маленький Харлампий» или просто «Харлам».

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: Харлук → Харлуков (чей сын? — Харлуков). Окончание -а в варианте Харлукова указывает на женскую форму, но фамилия склоняется по падежам и может принадлежать как мужчине (Харлуков), так и женщине (Харлукова).

Есть и вторая, менее вероятная, версия. В некоторых диалектах слово «харлук» могло быть прозвищем, связанным с глаголом «харкать» или «хрипеть» — так могли назвать человека с хриплым голосом или кашлем. Но эта версия слабее: имя Харлампий было широко распространено, и именно его производные дали жизнь большинству фамилий на Харл- (Харламов, Харлампьев, Харлуков). Прозвищная версия могла бы возникнуть, если бы не было имени-основы, но она есть.

Географически фамилия Харлукова тяготеет к регионам, где было распространено имя Харлампий и его народные формы: это центральные области России, Поволжье, а также территории, граничащие с Украиной и Белоруссией. Встречается она нечасто, что делает её более локальной и ценной для генеалогического поиска. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по имени отца — Харлука.