Фамилия Хатмуллин образована от арабского имени Хатмулла, что означает «печать Аллаха», «божественный знак» или «божественный отпечаток». Это имя указывает на человека, отмеченного Богом, что в мусульманской традиции считалось почётным и накладывало на носителя особую ответственность. Именно это имя и стало основой фамилии, закрепившись за потомками своего первого обладателя.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к восточному имени Хатмулла русский суффикс принадлежности -ин добавили по образцу фамилий типа «Саввин» или «Ильин». Форма Хатмуллин — это притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?», то есть «сын Хатмуллы», «наследник Хатмуллы». В тюркской среде, откуда фамилия родом, имя часто произносили с ударением на последний слог, что и отразилось в написании с двойной «л» — Хатмуллин, а не Хатмулин.

Исторические корни фамилии уходят в XV–XVII века, в эпоху, когда после распада Золотой Орды её выходцы — потомки печенегов, половцев и других тюркских племён — активно вливались в состав русского дворянства и служилого сословия. Многие нерусские по происхождению дворяне сохраняли свои родовые имена, которые со временем обрастали русскими суффиксами. Поэтому фамилия Хатмуллин — это не просто семейное прозвание, а живой след той эпохи, когда восточные имена органично вплетались в русскую ономастику.

Сам факт бытования такой фамилии говорит о том, что её родоначальник был человеком уважаемым, возможно, духовного звания или знатного происхождения — имена с компонентом «Аллах» в тюркской среде давали не случайно, а подчёркивая религиозную или социальную значимость семьи. Однако точных сведений о конкретном родоначальнике и его сословной принадлежности не сохранилось, и строить догадки здесь было бы нечестно.

Сегодня фамилия Хатмуллин встречается преимущественно в Поволжье и на Урале, среди татар и башкир, что полностью согласуется с её происхождением. В русском обиходе она закрепилась как фамилия, но по сей день сохраняет память о восточной письменности и культуре, будучи своеобразным памятником многовековому взаимодействию тюркского и славянского миров.