Фамилия Хаванцев относится к числу древних славянских семейных именований, образованных от личного прозвища. Сама модель, по которой возникла эта фамилия, — от прозвища через отчество к фамилии — широко представлена в ономастике восточных, западных и южных славян. В основе фамилии лежит прозвище Хаванец, и его происхождение имеет как минимум две убедительные версии.

Первая версия связывает прозвище с белорусским прилагательным «хаваны», что означает «спрятанный, хранимый». В этом случае Хаванцем могли назвать человека застенчивого, скромного, словно бы прячущегося от чужих глаз. Такое прозвище указывало бы на особенности характера и поведения обладателя. Эта гипотеза выглядит правдоподобной, поскольку корень «хав-» со значением «прятать, скрывать» широко распространен в белорусском и украинском языках.

Вторая версия рассматривает фамилию Хаванцев как фонетический вариант более известной фамилии Хованцев. Сама фамилия Хованцев происходит от прозвища, данного по названию реки Ховань (или Хованка), протекающей в Шаховском районе Московской области. Название реки, в свою очередь, восходит к украинскому глаголу «ховаться» — «прятаться, скрываться». Гидронимическое объяснение простое: река протекала в глухой лесистой местности, словно скрываясь от посторонних глаз. В таком случае прозвище Хованцев (а затем и Хаванец) указывало на место жительства человека, который жил в поселении на берегу этой реки.

Как бы то ни было, прозвище Хаванец закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования и со временем легло в основу фамилии. Потомки человека с таким прозвищем получили фамилию Хаванцев. Документальные подтверждения бытования фамилии встречаются в разных регионах России. Так, в Книге памяти Алтайского края упоминается Григорий Романович Хаванцев, родившийся в 1913 году в Томской губернии. В документах Республики Башкирия сохранились сведения о Егоре Ивановиче Хаванцеве, родившемся в 1911 году и проживавшем в Заичуринском районе Башкирской АССР. В документах Воронежской области можно найти сведения о Захаре Ивановиче Хаванцеве, родившемся в селе Красная Новь.

Такое широкое географическое распространение фамилии говорит о том, что прозвище Хаванец было известно в разных регионах, а сама фамилия могла возникать независимо в разных местностях. Интересно, что в обоих случаях — и от белорусского «хаваны», и от названия реки Ховань — смысл прозвища связан с идеей сокрытия, утаивания. Это делает фамилию Хаванцев семантически родственной таким фамилиям, как Хованский, Ховрин или Хованцев, и позволяет увидеть в ней отражение древних славянских представлений о скрытности и осторожности.