Фамилия Хайдапов — пример, где за привычным русским окончанием скрывается нерусская, скорее всего, тюркская основа. Суффикс -ов указывает, что фамилия формировалась в русской языковой среде по стандартной патронимической модели: «чей?» — «Хайдапов», то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Хайдап.

Самая вероятная версия происхождения основы — от тюркского мужского имени Хайдар (Гайдар). В разных тюркских языках оно означает «лев», «властелин» или «достойный». Имя широко распространено у башкир, татар, казахов, народов Кавказа. Фамилия Хайдапов могла возникнуть, когда русские писцы или священники адаптировали имя Хайдар под местную ойконимию: добавили уменьшительный или адаптированный суффикс -ап (от тюркского -ап/-еп, который встречается в прозвищах и именах), а затем и стандартный -ов. Другой вариант: основа Хайдап — это прозвище, образованное от глагола «хайдап» (в казахском, киргизском — «гнать», «погонять»). Так могли называть пастуха, погонщика скота или просто непоседливого, торопливого человека. В этом случае фамилия не патронимическая, а профессионально-характеризующая.

Географически фамилия Хайдапов тяготеет к регионам смешанного русско-тюркского населения: Башкортостан, Татарстан, Оренбургская, Челябинская области. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном, а не массовом происхождении. Сословно предки Хайдаповых, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами, реже — казаками, так как в дворянских родословных книгах эта фамилия не фиксируется.

Интересная деталь: двойной суффикс (-ап + -ов) делает фамилию похожей на отчества от тюркских имен, которые в XIX веке нередко «обрусевали» через добавление русского окончания. Если сравнивать с однокоренными, то Хайдаров встречается гораздо чаще, а Хайдапов — более редкий вариант, сохранивший в основе местный, диалектный вариант имени.