Фамилия Хишко — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не оставило следов в словарях. В современном русском языке слово «хиш» отсутствует, но оно могло бытовать в юго-западных говорах как вариант «хищ» или «хиж» — в значении «хищник», «ловкий, жадный человек». Устойчивее другая версия: основа восходит к украинскому или белорусскому «хижа» (хижина, лачуга) или «хижак» (хитрец). Тогда Хишко — это либо «житель ветхой избы», либо «плут». Оба значения вполне в духе народных прозвищ, которые не льстили, а метко описывали.

Суффикс -ко — типичный для украинской и белорусской антропонимии уменьшительно-ласкательный или принадлежностный. В фамилиях он часто указывал на молодого человека, сына или подмастерья: Хишко могло значить «маленький Хиш» или «сын Хиша». По модели это близко к фамилиям Хижко, Хищенко, Хижняк. Географически фамилия встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и на юго-западе Беларуси (Брестчина) — именно там, где «хижа» и «хижак» были в ходу. В России она редка и, скорее всего, занесена переселенцами.

Сословного барьера у фамилии не было: её могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане. В реестрах Войска Запорожского XVII–XVIII веков встречаются схожие прозвища (Хижко, Хишняк), что указывает на казачью среду как на один из источников. Правописание с «ш» вместо «ж» — результат местного произношения или ошибки писаря: в живых говорах «хиш» и «хиж» могли звучать одинаково.

Спорных версий немного. Самая натянутая — связь с тюркским «хиш» (ровесник, друг) — маловероятна для украинско-белорусского ареала. Куда правдоподобнее, что Хишко — это сжатая форма от Хищенко или Хишковский, где суффикс -ко заменил более длинные окончания. В любом случае, фамилия говорит о предке, которого окружающие запомнили либо по его дому, либо по характеру.