Основой фамилии Хлопотинин послужило церковное имя Хлопота. Мирское имя Хлопотина образовано от существительного «хлопота» со значением «забота, беда, противный случай». Так, нарекая ребенка Хлопотиной, близкие желали ему удачливой и счастливой судьбы. Не исключено, что фамилия Хлопотинин происходит от прозвища Хлопотина, которое восходит к глаголу «хлопотать», то есть «беспокоиться о чем-то, суетиться». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Хлопотина, со временем получил фамилию Хлопотинин.