Фамилия Хлопотонова — женская форма от Хлопотонов, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель образования простая: основа «хлопот-» плюс типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Хлопотонов). Это патронимическая фамилия, то есть образованная от имени или прозвища отца. В основе лежит слово «хлопоты» — заботы, суета, беспокойство.

Кем мог быть предок, носивший прозвище Хлопотун? В словаре русских прозвищ и фамилий такая модель встречается часто: Хлопотун, Хлопота, Хлопуша — все они описывали человека суетливого, деятельного, возможно, хлопотливого хозяина или того, кто постоянно был в делах. Прозвище могли дать как в насмешку (за излишнюю суету), так и с уважением (за усердие и заботливость). В говорах XIX века «хлопотун» означал также человека, который много работает по дому или хозяйству, — здесь нет негативного оттенка.

Словообразовательный нюанс: фамилия на -ов, а не на -ин, что типично для прозвищ, а не для крестильных имён. Если бы основа была от имени (например, Филипп → Филиппов), суффикс был бы тот же, но прозвищная природа чаще встречается у фамилий с такой «бытовой» корневой основой. В ономастических работах, например у Б. Унбегауна, подобные фамилии относят к группе «от прозвищ по характеру и поведению».

Географическая привязка фамилии Хлопотонов (и Хлопотонова) не широкая, но встречается в центральных и северных губерниях России. В метрических книгах XVIII–XIX веков носители фиксируются в основном в Ярославской, Костромской и Вологодской губерниях — регионах, где было распространено прозвищное именование по поведенческим чертам. Встречаются также варианты с чередованием: Хлопотунов, Хлопотов — но Хлопотонов звучит как более диалектная форма (с усечением «ун» до «он»).

С точки зрения социального контекста: фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. В списках купцов и дворян она не фиксируется, что подтверждает её прозвищное происхождение из простонародной среды. Ударение в фамилии, судя по аналогиям (Хлопотун → Хлопотонов), падает на второй слог: Хлопотонова.