Фамилия Хлюпина образована от прозвища Хлюпа. Оно ведет свое начало от глагола «хлюпать» - «шлепать по воде и грязи», «плакать, всхлипывать». Вероятно, прозвище отражало особенности характера и поведение основателя фамилии (неряшливость, неаккуратность, либо плаксивость, робость, чувствительность). В «Ономастиконе» Веселовского записан Хлюпин Безнос Муратов, подьячий, 1570 г. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Хлюпа, со временем получил фамилию Хлюпина.