Фамилия Хмарин напрямую связана с именем или прозвищем Хмара, которое и стало её основой. В старину на Руси это слово бытовало в народных говорах и означало ненастную, пасмурную погоду, тучу, облако. Поэтому первая и самая очевидная версия происхождения — «погодная»: Хмарой могли назвать ребёнка, родившегося в хмурый, дождливый день. Такие именования по состоянию природы в момент появления на свет — распространённая практика в мире имён, где отражались приметы и обстоятельства жизни.

Однако есть и другая, не менее правдоподобная трактовка. Хмарой в народе нередко называли человека угрюмого, невесёлого, «пасмурного» нравом. В этом случае прозвище указывало не на погоду, а на характер: так могли сказать о молчаливом, задумчивом или постоянно хмуром человеке. Подобные прозвища по чертам характера давали людям очень часто, и они легко закреплялись за потомками.

Существует и третья, более тонкая версия — охранительная. В древности родители, желая уберечь ребёнка от злой судьбы, нарочно давали ему «плохие» имена. Считалось, что если назвать дитя Хмарой, то есть «пасмурным», то злые духи не позарятся на него, а сама жизнь, наоборот, подарит ему счастье и веселье. Такой приём — давать имя с отрицательным значением ради оберега — хорошо известен этнографам.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русских родовых имён: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Хмарин буквально означает «сын Хмары», «ребёнок того, кого звали Хмара». По этой же модели образованы многие русские фамилии от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я.

Интересно, что однокоренные фамилии — Хмаров, Хмара, Хмарук — встречаются как у русских, так и у украинцев и белорусов, что говорит о широком бытовании этого слова в разных славянских диалектах. В целом, какая бы из версий ни оказалась верной для конкретного рода, фамилия Хмарин сохранила в себе отголосок древнего народного слова, которое сегодня почти исчезло из живой речи.