Фамилия Хмарина напрямую связана с древним славянским миром имён. Её основа — не церковное, а мирское имя или прозвище Хмара, которое в древнеславянском языке означало «туча». В некоторых диалектах хмарой до сих пор называют ненастную, пасмурную погоду. От этого же корня происходит и украинское слово «хмара» в значении «облако».

Самая вероятная версия происхождения этого имени — «погодная». Родители могли назвать ребёнка Хмарой, если он появился на свет в пасмурный, дождливый день. Такие имена по погоде были обычным делом в среде простых людей: они не несли негативного смысла, а просто фиксировали обстоятельства рождения.

Существует и охранительная версия. Согласно ей, имя Хмара давали нарочно, чтобы обмануть злых духов: считалось, что ребёнок с «мрачным» именем не привлечёт их внимания, а вырастет счастливым и весёлым. Эта практика была широко распространена у славян, поэтому полностью исключать её нельзя.

Третья версия относит Хмару к прозвищам, которые давали уже взрослому человеку за характер. В этом случае прозвище получал угрюмый, невесёлый, «пасмурный» человек. Такое прозвище легко могло закрепиться в качестве родового имени.

Словообразовательная модель фамилии проста и характерна для русского севера и центра России. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хмарина — это «дочь или жена Хмары». Если бы речь шла о мужчине, фамилия звучала бы как Хмарин. Такая форма говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где основой служило имя отца или мужа, а не географическое название.

Стоит отметить, что фамилия Хмарина встречается реже, чем её мужской аналог, и часто бытует в формах с ударением на первый слог — Хмарина. Это отличает её от однокоренных, но более поздних фамилий вроде Хмаров или Хмаренко, которые образованы по другим моделям и чаще встречаются на Украине и юге России.

Какую из трёх версий выбрать — вопрос без однозначного ответа. Погодная гипотеза выглядит самой естественной для крестьянской среды, где имя давали по обстоятельствам. Охранительная версия правдоподобна, но менее доказуема. Прозвищная — самая простая, но она объясняет лишь единичный случай, а не устойчивую традицию. Скорее всего, в каждом конкретном роду Хмариных причина была своя, и теперь её уже не восстановить.