Фамилия Хорунжый — один из тех случаев, когда написание и произношение вносят путаницу, а происхождение, наоборот, прозрачно. Встречаются варианты Хорунжий, Хорунжей и даже Хорунжак, но все они восходят к одному корню. Основа фамилии — слово «хорунжий» (или «хорунжей» в старом произношении). Так на Руси, а позже в Речи Посполитой и Российской империи называли знаменосца: человека, который носил полковое знамя — хоругвь. Слово пришло из польского языка (chorąży), где chorągiew — это и знамя, и конная хоругвь (подразделение).

Модель образования здесь простая и редкая для русских фамилий. Обычно фамилии от воинских чинов образовывали с суффиксом -ов: Пушкарь → Пушкарёв, Стрелец → Стрельцов. Но Хорунжый — это субстантивированное прилагательное, то есть чистое прозвище без добавочного суффикса. Носитель фамилии — это и есть тот самый «хорунжий», знаменосец. Такая модель характерна для украинских и белорусских земель, где фамилии на -ий, -ый (Толстый, Гнилый, Задорожный) встречаются гораздо чаще, чем в северной России. Поэтому географически фамилия Хорунжый тяготеет к юго-западу: Украина, юг Беларуси, а также казачьи области (Кубань, Дон), где чин хорунжего был распространён в казачьих войсках.

С социальной точки зрения носитель фамилии мог быть не просто знаменосцем, а младшим офицерским чином. В Запорожской Сечи хорунжий отвечал за войсковое знамя и пользовался большим авторитетом. Позже, в Российской империи, хорунжий — это первый офицерский чин в казачьих войсках, аналог корнета. Однако фамилия могла закрепиться и за крестьянином, который нёс службу хорунжего в ополчении, или за ремесленником, получившим такое уличное прозвище за манеру держаться или за то, что жил возле хоругви (церковного знамени).

Спорных версий две, и обе слабые. Первая — от тюркского корня «хорун» (защита, крепость). Но она не объясняет конечное -жый и не выдерживает критики, так как слово «хорунжий» — общеславянское заимствование из польского, а не тюркизм. Вторая — от глагола «хоронить» (прятать). Это народная этимология, лингвистически несостоятельная: корни разные, и семантика не совпадает.

В написании «Хорунжый» с буквой «ы» на конце — это не ошибка, а диалектная или историческая особенность передачи окончания. В старых документах и в украинском языке форма на -ый звучала твёрже, чем в литературном русском. Так что если вы встретили именно такое написание — скорее всего, перед вами фамилия украинского или кубанского происхождения, где твёрдое «ы» сохранялось дольше.