Фамилия Христонько звучит как украинская, и это верное первое впечатление. Её выдает суффикс -енко, который в украинской ономастике означает «сын» или «потомок». Однако здесь он перешел в форму -онько, что встречается реже и часто указывает на западноукраинское или белорусское происхождение, где гласные могли редуцироваться или меняться под влиянием местных говоров. Основа фамилии — Христонь, которая восходит к имени Христоня.

Христоня — это не церковное каноническое имя, а народная, бытовая форма от крестильного имени Христофор (в переводе с греческого — «носящий Христа»). На Руси и в Малороссии длинные греческие имена часто сокращали и «обкатывали» до простых и ласковых вариантов: Христоня, Христя, Христуня. Таким образом, Христонько буквально означает «сын Христони», то есть потомок человека, которого в быту звали Христофором.

В отличие от фамилий на -ов или -ин, которые фиксировали принадлежность отцу (чей сын?), фамилии на -енко (и его вариант -онько) изначально были более личными и часто закреплялись за конкретным родом в казацкой среде. Носитель фамилии Христонько, скорее всего, происходил из семей запорожских казаков или крестьян Правобережной Украины, где такие патронимические формы были особенно распространены в XVII–XVIII веках. Географически фамилия чаще всего встречается в Черниговской, Полтавской и Харьковской областях, а также в приграничных районах Беларуси.

Интересная деталь: фамилия Христонько не имеет ничего общего с прямым именованием «Христос» или религиозным титулом. Это чисто бытовая производная от редкого сейчас имени Христофор, которое в народе переосмыслили и сократили. Поэтому искать в ней сакральный смысл не стоит — это просто указание на предка по имени Христофор, которого в деревне звали Христоней.