Фамилия Хрупкин образована от прозвища или нецерковного имени Хрупка. В основе лежит прилагательное «хрупкий» — ломкий, нежный, слабый. В старину такое прозвище могли дать человеку тщедушного телосложения, болезненному или, наоборот, с иронией — рослому и крепкому парню. Впрочем, у слова есть и другой оттенок: в некоторых говорах «хрупкий» означало «щеголеватый», «нарядный», так что прозвище могло относиться к человеку, который следит за одеждой.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хрупкин буквально значит «сын Хрупки». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я. Если бы основа оканчивалась на согласный, мы бы получили Хрупков, но здесь сработала грамматика женского склонения, хотя прозвище могло принадлежать и мужчине.

Фамилия редкая, в массовых списках не встречается. Можно предположить, что её носители происходят из северных или центральных областей России, где суффикс -ин более распространён, чем -ов. Встречаются написания с удвоенной «п» — Хруппкин, но это, скорее, вариант описки или диалектного произношения.

Однокоренные фамилии — Хрупков, Хрупкий, Хрупко. Последняя характерна для украинской традиции. Все они восходят к одному корню, но Хрупкин стоит особняком из-за суффикса, который указывает на конкретное лицо по прозвищу, а не на абстрактный признак.