Фамилия Худшев — довольно редкая, но её происхождение прочитывается почти прозрачно. В основе лежит древнерусское слово «худой», которое в старину означало не только «тощий», но и «плохой», «неказистый», «слабый», а также «бедный». Прозвище Худой, а затем и Худыш, Худенький давали человеку невысокого роста, тщедушного телосложения или же тому, кто жил скудно и не имел достатка. Фамилия образована по стандартной патронимической модели: от прозвища или имени Худыш (или Худш) через суффикс -ев.

Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или шипящий. В данном случае это, скорее всего, форма Худш (от «худший» — сравнительная степень) или краткая форма имени Худыша. То есть фамилия буквально значит «сын Худша» или «потомок Худшего». Интересно, что в русских говорах слово «худший» могло быть не оскорблением, а бытовой характеристикой: так называли младшего в семье или того, кто занимал низшее положение в общине.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и южнорусских регионах, а также в Поволжье. В XIX веке носители Худшевых чаще всего были государственными крестьянами или мещанами, реже — однодворцами. В некоторых переписях XVII–XVIII веков встречаются варианты написания — Худшов и Худшев, что подтверждает неустойчивость окончания в ранних документах.

Стоит отметить, что фамилия Худшев не имеет отношения к тюркским корням, хотя по звучанию может напоминать фамилии с арабским корнем «худж» (святой). Русская этимология здесь первична, и попытки связать её с восточными языками — натяжка. Однокоренные фамилии — Худяков, Худов, Худышев — более частотны, но Худшев стоит особняком из-за редкой формы основы.