Фамилия Хусейнов — это отчество в форме притяжательного прилагательного, то есть буквально «сын Хусейна», «принадлежащий Хусейну». Русский суффикс -ов, добавленный к мусульманскому имени, — самый распространённый способ адаптации тюркских и арабо-персидских имён в русскоязычной среде, поэтому фамилия звучит естественно для носителя русского языка, но указывает на восточные корни предка.

Основа фамилии — арабское имя Хусейн (Ḥussayn), которое переводят как «красивый», «хороший», «добрый». Это уменьшительная форма от имени Хасан, и в арабской традиции существовал обычай давать имена Хасан и Хусейн двум мальчикам-близнецам. Поэтому если в роду были двойняшки, одного из них часто нарекали именно Хусейном.

Для мусульманского мира это имя имеет особый сакральный смысл. Хусейн ибн Али — внук пророка Мухаммеда, сын Али и Фатимы, третий шиитский имам. После гибели старшего брата Хасана он возглавил восстание в Куфе против Омейядов, но потерпел поражение. 10 октября 680 года имам Хусейн погиб в битве при Кербеле вместе с небольшим отрядом сторонников, сражаясь против войск халифа Язида. Этот день стал траурным для шиитов, его отмечают как шахсей-вахсей — день поминовения, когда верующие скорбят о мученической кончине имама.

В отличие от многих русских фамилий, которые часто происходят от прозвищ или профессий, Хусейнов напрямую восходит к личному имени. Это значит, что предок носителя фамилии был человеком, которого звали Хусейн, а его дети и внуки закрепили за собой именование «Хусейновы». Фамилия распространена среди народов Кавказа, Поволжья и Средней Азии, где исламская традиция имён сочеталась с русской моделью образования фамилий. Встречаются и варианты написания — Гусейнов, Хусаинов, — которые отражают разное произношение имени в локальных диалектах.