Фамилия Кибер — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами не типичная крестьянская или дворянская фамилия центральной России, а скорее позднее заимствование или искусственное образование.

Самая вероятная версия — немецкое или еврейское (ашкеназское) происхождение. В немецком языке слово «Kieber» или «Kiber» могло быть профессиональным прозвищем. В южнонемецких диалектах «Kieber» — это «клевер» (растение), а в некоторых регионах так называли сборщика клевера или крестьянина, засевавшего поля этой культурой. Однако более распространённое значение — «тот, кто колет, дробит» (от глагола «kieben» — раскалывать, дробить камень). Такое прозвище мог получить каменотёс или работник в каменоломне.

В еврейской среде фамилия Кибер (и её вариации Кибир, Киберман) могла возникнуть как искусственная или топонимическая — от названия местечка Кибартай (ныне Литва) или от идишского «кибер» (связано с «кибур» — могила, кладбище). В таком случае фамилия указывала на место жительства или род занятий, связанный с похоронным делом. Встречается она преимущественно среди евреев-ашкеназов, переселившихся в конце XIX века в черту оседлости Российской империи.

Словообразовательная модель проста: фамилия бессуффиксная, образована напрямую от прозвища или названия профессии. В русском языке она не склоняется как типичная славянская фамилия, что тоже подтверждает её иноязычные корни. Встречается в документах конца XIX — начала XX века в западных губерниях (Волынская, Подольская, Киевская), а также среди выехавших в США и Аргентину.

Есть и маловероятная, но любопытная версия: в некоторых говорах русского севера словом «кибер» называли кипу, тюк или связку чего-либо (от «кибить» — гнуть, сгибать). Но эта гипотеза не имеет серьёзной поддержки в ономастике, так как фамилия не фиксируется в старых писцовых книгах и переписях центральных регионов.

Таким образом, скорее всего, предки носителей фамилии Кибер — либо немецкие колонисты-каменотёсы, либо еврейские ремесленники или торговцы из западных губерний. В любом случае, это фамилия-маркер: она сразу говорит о невеликорусском происхождении и, вероятно, о довольно позднем появлении на территории России (не раньше XVIII века).