Фамилия Кильчичакова — самобытный памятник восточной культуры, и её происхождение не сводится к одному очевидному корню. Ономасты предлагают как минимум две версии, и обе по-своему убедительны.

Первая гипотеза связывает фамилию с хакасским личным именем Кильчичак. Его разбирают на две части: хакасский корень «кил» — «прибывать, приходить» и общетюркское слово «чичак» — «цветок». В этом случае имя Кильчичак означает «родился цветок»: так могли назвать долгожданного или очень любимого ребёнка, который радует родителей. Такая модель имянаречения — через метафору распустившегося цветка — типична для тюркских культур.

Вторая версия предлагает прозаическую основу. Согласно ей, в фамилии лежит прозвище Кильчичак, образованное от тюркского слова «кильчи» — «углежог» — с помощью уменьшительного суффикса «-чак». Если это так, то прозвище относилось к числу «профессиональных» именований и указывало на занятие предка: выжигание древесного угля. Суффикс мог придавать прозвищу оттенок ласкательности или указывать на младшего в семье углежога.

Какая из версий правдоподобнее? Имя Кильчичак как личное имя встречается в хакасской среде и сегодня, а связка «киль» + «чичак» даёт красивое семантическое целое. Версия с прозвищем от «кильчи» тоже лингвистически состоятельна, но менее поэтична. Скорее всего, фамилия восходит именно к личному имени — это распространённый путь образования фамилий у тюркских народов Сибири.

Архивы подтверждают, что фамилия бытовала в Хакасии с XIX века. В архивах МВД Республики Хакасия записана Кильчичакова Арина Гордеевна, родившаяся в 1883 году. А в Книге памяти Республики Хакасия отмечена Кильчичакова Татьяна Георгиевна, 1905 года рождения, из Аскизского района. Эти записи показывают, что фамилия была распространена в центральной части Хакасии, в районе Аскиза, и что её носительницы — коренные жительницы региона.

Фамилия образована по типичной для русского языка модели: к основе имени или прозвища добавлен суффикс «-ов», а затем стандартное окончание «-а» для женского варианта. Таким образом, Кильчичакова — это «дочь (или жена) Кильчичака». Мужская форма фамилии — Кильчичаков.