Фамилия Кимяев образована от имени Кимяй. Скорее всего, оно восходит к татарскому слову «ким» - «неполный, недостаточный; меньший». Вероятно, так называли младшего сына в семье. Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит турецкое слово kimya – «химия». В этом случае прозвище Кимяй мог получить человек, занимавшийся изучением химии.