Фамилия Киприсян — редкий случай, когда корень слова не вызывает споров, а вот путь, которым фамилия попала в русский язык, заставляет задуматься. Основа здесь очевидна: «Киприс» — это краткая, обиходная форма крестильного имени Киприан (от латинского Cyprianus — «кипрский», то есть уроженец или житель острова Кипр). В православных святцах это имя известно по священномученику Киприану, епископу Антиохийскому.

Главная особенность Киприсян — суффикс «-ян». Он однозначно указывает на восточное, скорее всего армянское, происхождение модели фамилии. В армянском языке суффикс «-ян» (и его варианты «-янц», «-енц») означает принадлежность к роду: «из рода Киприса», «потомок Киприса». Однако сам корень «Киприс» — не армянский, а греческий или русский (через церковную традицию). Это наводит на мысль, что фамилию могли получить армяне, жившие в Крыму или на юге России, где православное имя Киприан было в ходу, а фамилии оформляли по местному армянскому обычаю.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: фамилия могла возникнуть в среде греков или русских, а затем подвергнуться «арменизации» при записи в документах XIX века. В многонациональных регионах Российской империи (Новороссия, Кубань, Закавказье) чиновники часто добавляли «-ян» к фамилиям, звучавшим по-армянски, или сами носители меняли окончание для единообразия.

С точки зрения словообразования, фамилия Киприсян — это патроним (отчество), превратившееся в родовое имя. Исходное прозвище Киприс — усечённая форма, характерная для бытовой речи: так могли звать человека, которого в семье или деревне называли не полным именем, а сокращённо, с ласковым или фамильярным оттенком. Аналогичные образования — Ивасян (от Иван), Герасисян (от Герасим).

Социальный контекст: носители фамилии Киприсян, скорее всего, происходили из среды мещан, ремесленников или крестьян южных губерний. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Встречаемость фамилии крайне низкая — это не массовая, а штучная фамилия, что делает её особенно ценной для семейной истории: каждый носитель, вероятно, восходит к одному небольшому роду.