Фамилия Кипрушенков — редкий пример того, как крестильное имя обрастает не одним, а сразу двумя суффиксами, выдавая сложный путь словообразования. В основе лежит каноническое имя Киприан (от латинского Cyprianus — «кипрский», то есть родом с острова Кипр). В русском быту имя часто сокращали и переделывали на свой лад: Киприан превращался в Киприян, потом в Кипрушу, а затем и в Кипрушу с суффиксом -енк-, который в южнорусских и украинских землях означал «маленький» или «сын». Так появилось прозвище Кипрушенко — «сын Кипруши».

Форма Кипрушенков — это уже великорусская переделка украинской или белорусской фамилии. Суффикс -ов добавили, когда носитель фамилии Кипрушенко переселился в центральные или северные области России, где фамилии на -ов были нормой. Таким образом, фамилия дважды указывает на родство: сначала через -енк-, потом через -ов. Сравните с однокоренными: Киприянов, Кипров, Кипреев — все они восходят к тому же имени, но по-разному.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины, но встречается рассеянно. Поскольку имя Киприан в народе было не слишком частым (в отличие от Ивана или Петра), носителей Кипрушенковых немного. В метрических книгах XIX века такую фамилию могли записать и как Кипрушенко — в зависимости от грамотности писаря и местных традиций.

Социальный контекст прост: предки были скорее всего крестьянами или мещанами. Духовенство редко брало такие «двойные» суффиксы — оно предпочитало семинарские фамилии на -ский. А вот в крестьянской среде прозвище по отцу закреплялось легко и естественно. Если ваш предок носил фамилию Кипрушенков, он, вероятно, происходил из семьи, где деда или отца звали Кипруша — уменьшительно от Киприан.