Фамилия Кипрушов — редкий пример того, как личное имя превратилось в фамилию через нестандартный суффикс. В основе лежит имя Киприан (или его просторечная форма Киприян), которое восходит к греческому «Киприос» — уроженец острова Кипр. В русской традиции имя сокращалось до Кипруша, как уменьшительно-ласкательный вариант. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Кипруша». Так из прозвища или домашнего имени отца возникла фамилия.

Особенность фамилии — в суффиксальной модели. Обычно от имён на -а образуют фамилии на -ин (Кипрушин), но здесь закрепился вариант на -ов, что встречается реже. Вероятно, это связано с диалектным произношением или влиянием фамилий на твёрдый согласный. Форма Кипрушов могла возникнуть в среде, где имя Кипруша воспринималось как основа с окончанием на согласный, а не на -а.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России, где имя Киприан было распространено среди крестьян и мещан. В документах XIX века встречаются единичные записи в Воронежской и Тамбовской губерниях. Это типичная «отчество-фамилия»: предок носителя был крещёным человеком по имени Кипруша, а его дети получили прозвание по отцу.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Киприянов, Кипреев, Кипрушин — показывает, что Кипрушов стоит особняком. Если Киприянов — книжная, полная форма, то Кипрушов — сугубо народная, разговорная. Это указывает на низкое социальное происхождение носителей: среди дворян и духовенства такие фамилии не встречались. Фамилия не получила широкого распространения, и сегодня её носители — скорее всего, потомки крестьян из чернозёмной полосы.