Фамилия Кирдеева — типичный пример русской фамилии на -ев, образованной от мужского имени или прозвища Кирдей. Основа здесь не славянская, а мордовская: имя Кирдей происходит от эрзянского или мокшанского глагола «кирдемс», что значит «терпеть» и «держать». Имя, скорее всего, было «охранительным»: родители надеялись, что ребёнок вырастет стойким и выносливым. Мордовские имена нередко становились прозвищами в русскоязычной среде, а затем и фамилиями — так появились Кирдеевы.

Существует и другая версия, менее убедительная. Согласно ей, Кирдей — прозвище от слова «кирд». Что это за слово, неясно; возможно, искажённое «кирка» или диалектное название какого-то орудия. Но надёжных подтверждений у этой гипотезы нет, и большинство ономастов склоняются к мордовскому происхождению.

Фамилия Кирдеева сравнительно редкая. Её можно встретить в Поволжье — в Мордовии, Татарстане, Нижегородской и Самарской областях, где исторически жили мордовские народы. Встречается она и в Сибири, куда переселенцы уходили в XIX–XX веках. Суффикс -ев указывает на стандартную модель: «чей?» — Кирдеев, то есть сын Кирдея.

Написание с двойной «е» — Кирдеева — женская форма фамилии. Мужская, соответственно, Кирдеев. В документах встречаются варианты Кирдеев, Кирдяев, Кирдев, но основной вариант закрепился именно с двумя «е», что соответствует произношению.