Фамилия Кирциянова — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходную основу. На слух она кажется «инородной», но на деле это типичная русская фамилия, образованная от крестильного имени с помощью суффикса принадлежности.

В основе лежит имя Кирция — народная форма церковного имени Кир (от греческого «kyrios» — господь, владыка) или, что вероятнее, уменьшительная форма от имени Кирилл (Кирилл → Киря → Кирция). Имя Кир в святцах встречается редко, а вот Кирилл было распространено на Руси повсеместно. Суффикс -ин (-ын) указывает на принадлежность: Кирциянов — буквально «сын Кирции». Однако в современном написании фамилия выглядит как Кирциянова, а не Кирциина. Это объясняется тем, что в русской ономастике фамилии на -инов нередко возникали из форм с суффиксом -ин, когда основа оканчивалась на -ия: Кирция → Кирциин → со временем, под влиянием произношения или при записи, перешло в Кирциянов. Такая же модель работает в фамилиях типа Ильин — Ильянов (редкий вариант) или Фомин — Фоминов.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским говорам, где аканье и «цоканье» давали формы вроде Кирцан, Кирция. Предок-носитель фамилии мог быть крестьянином или посадским человеком, которого в документах записали по отцу — Кирции. Прозвищного значения у фамилии нет: она чисто патронимическая, без намёка на ремесло или внешность.

В дореволюционных списках фамилия почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, она возникла в одной-двух деревнях и не получила широкого распространения. Женская форма Кирциянова — это вариант, закреплённый за женщиной в браке или по отцу, но в современном употреблении она чаще воспринимается как исходная, поскольку фамилия редкая и не склоняется по роду в бытовой речи.