Фамилия Кисаровы (в мужском роде — Кисаров) образована от прозвища Кисар. Самая распространённая версия связывает его с тюркскими языками, в частности с турецким словом kasara — «короткий». Скорее всего, прозвище Кисар дали человеку невысокого роста. Это типичная для тюркской традиции модель прозвища по внешнему признаку: она кратка, метка и сразу описывала носителя.

Словообразовательная модель фамилии проста и показательна: основа Кисар- плюс русский патронимический суффикс -ов. Это значит, что фамилия закрепилась за потомками человека по имени или прозвищу Кисар, уже в русской языковой среде. Такой суффикс — самый массовый в русских фамилиях, и его использование здесь говорит о том, что тюркское прозвище было адаптировано в славянской среде, возможно, при переходе носителей в православие или при длительном соседстве народов.

Иногда Кисара пытаются возвести к арабскому слову «кисар» (кесарь, царь) или к библейскому имени Кир, но эти версии слабее. Тюркское происхождение от «короткого» объясняет прозвище бытовой логикой, а не книжной традицией, и потому выглядит убедительнее. Словарь тюркизмов в русском языке фиксирует подобные корни, и фамилия Кисаров вписывается в ряд однокоренных: Кисаркин, Кисарчук, которые тоже отталкиваются от прозвища, а не от имени.

Географически фамилия встречается в Поволжье, на Урале и в Сибири — в регионах, где веками шёл активный контакт русского и тюркского населения. Точное сословие первых Кисаровых не установлено, но прозвищный характер фамилии указывает, что её основателями были не князья и не духовенство, а простые люди — крестьяне, посадские или служилые татары, получившие русскую фамилию при переписях. Точную дату возникновения назвать невозможно: фамилии такого типа складывались в XV–XVII веках, но письменно закрепились позже, в ревизских сказках XVIII–XIX столетий.