Фамилия Кистина — женская форма фамилии Кистин, и её история начинается с мужского прозвища Киста. Само прозвище могли дать по двум совершенно разным причинам, и обе версии имеют право на существование.

Первая версия связывает Кисту с диалектным глаголом «кистать». В народной речи это слово означало «пачкать, марать, грязнить». Соответственно, прозвище Киста мог получить неаккуратный, неряшливый человек, за которым закрепилась репутация небрежного. В таком случае прозвище носило иронический оттенок и указывало на привычку ходить в испачканной одежде.

Вторая версия уводит нас в финно-угорские языки. В мокшанском языке есть слово «киста», которое переводится как «дорога». Если принять эту гипотезу, прозвище Киста давали человеку, жившему у дороги или при большой трактовой дороге. Такое именование было удобным ориентиром для соседей и со временем закрепилось за целым родом.

Фамилия образована по стандартной русской модели с патронимическим суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кистин, то есть сын Кисты. Позже от мужской фамилии возникла женская форма Кистина. Встречается эта фамилия в основном в центральных и поволжских регионах России, где исторически были сильны мордовские влияния, что косвенно подтверждает вторую версию происхождения.