Фамилия Кладогуб — одна из тех, что сразу вызывает вопрос: что означает вторая часть? Если первая половина, «кладо-», прозрачно намекает на клад или кладовую, то «-губ» ставит в тупик. На самом деле перед нами составное прозвище, где вторая часть — не от «губы», а от глагола «губить». Кладогуб — тот, кто губит клады, то есть разоряет схроны или, в переносном смысле, нерадиво тратит припрятанное добро. Слово «клад» в древнерусском языке имело и оттенок «сокровище, зарытое в землю», поэтому прозвище могло закрепиться за кладоискателем, который вскрывает тайники, или за человеком, который по легкомыслию промотал накопленное.

Модель образования редкая: основа из двух корней без соединительной гласной (чистое сложение) плюс нулевой суффикс. Такие прозвища — Кладогуб, Горемыка, Скоробогач — типичны для северных и центральных говоров, где ценилась краткость. Фамилию зафиксировали в основном на северо-западе России, в Новгородской и Псковской губерниях, где кладоискательство было не просто промыслом, а частью местного фольклора. Встречается она и в белорусских землях, где «клад» означал ещё и «имущество», а «губиць» — «портить».

Ударение, судя по говорам, падает на последний слог: Кладогу́б. В письменных источниках XVIII–XIX веков фамилия иногда записывалась через «а» — «Кладогубъ», что подтверждает её прозвищное происхождение: звук «о» в безударной позиции не редуцировался, как в литературном языке.

Однокоренных фамилий почти нет — это делает Кладогубов ярким маркером небольшой локальной группы. Сравните с фамилией Кладовщиков (от профессии) или Кладобой (тот, кто разбивает клады молотом), но Кладогуб стоит особняком: он не хранитель и не добытчик, а разрушитель. Возможно, прозвище давали не в похвалу, а с иронией — человеку, который случайно или намеренно испортил чужой схрон, либо тому, кто «загубил» своё наследство.