Фамилия Кленогин — редкий случай, когда основа угадывается без словаря, но происхождение оказывается не таким прозрачным, как кажется. На первый взгляд, корень «клен» отсылает к дереву. Однако в русских фамилиях, образованных от названий растений, обычно встречаются суффиксы -ов/-ев (Кленов) или -ин (Кленин). Суффикс -огин здесь выбивается из ряда, и именно он — ключ к разгадке.

Скорее всего, Кленогин — это русифицированная форма фамилии из западнославянских или украинского языков. В белорусском и украинском бытует прозвище Кленога — человек, живущий у клёна или имеющий какое-то отношение к этому дереву (например, кленовый сок, древесина). Суффикс -ога в этих языках придаёт слову оттенок характерности: не просто «клён», а «кленовый человек». Когда носитель такой фамилии попадал в великорусскую среду, её переоформляли по русской модели притяжательных прилагательных: Кленога + -ин = Кленогин, то есть «сын Кленоги».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «кленогать» (в некоторых говорах — стучать, бренчать, издавать глухой звук). Тогда прозвище Кленога мог получить шумный человек, кузнец или даже музыкант, игравший на простом инструменте. Но эта гипотеза слабее, так как глагол узкорегиональный и не фиксируется в центральных говорах.

Географически фамилия тяготеет к юго-западу России и востоку Украины. В дореволюционных переписях Кленогины встречаются в Курской, Воронежской губерниях и на Слобожанщине — регионах, где веками смешивались русское и украинское население. Сословно это почти наверняка крестьяне или однодворцы: фамилия недворянская, без герба, и в XIX веке её носители не поднимались выше мещанства.

В написании возможна путаница: иногда фамилию записывали как Кленягин (через «я»), что ещё сильнее отдаляет её от дерева и сближает с личными именами (Кленя — уменьшительное от Клементий или Акакий). Но вариант Кленогин устойчивее и, судя по архивным данным, исходный.