Фамилия Клиньё — редкий случай в русской ономастике, где ударение падает на последний слог, а само слово заканчивается на «ё». Это почти всегда указывает на позднее, диалектное или искусственное происхождение, либо на то, что фамилия возникла из прозвища, которое местные жители произносили именно так.

Скорее всего, в основе лежит слово «клин» — в самом широком смысле. Это мог быть не только кусок металла или дерева, но и участок земли (земельный клин), а также деталь одежды (ластовица). Прозвище Клин, а затем и фамилия Клиньё могло закрепиться за человеком, который жил на клинообразном наделе, владел таким участком, или же за портным, который хорошо умел вшивать клинья. Менее вероятна, но возможна связь с ремеслом кузнеца или плотника, где клин — основной инструмент.

Обратите внимание на суффикс. Окончание -ёв (в твёрдой записи — -ё) характерно для фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на мягкий согласный или шипящий: Клин → Клиньё (буквально «чей?» — Клиньёв, но в разговорной речи и документах часто фиксировали без конечного -в). Это типичная модель для северных и некоторых западных говоров (ср. фамилии Шевелёв, Копьёв). В официальных записях XIX века фамилия могла писаться как Клиньев, но носители произносили её на свой лад, что со временем закрепилось в написании.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Она практически не встречается за пределами России и имеет точечную географию — единичные записи в Псковской, Тверской и Новгородской областях. Это подтверждает версию о её диалектном происхождении: в этих краях слово «клин» в значении «клочок земли» было особенно употребительно. Сословно предки носителя фамилии, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, получившими фамилию по месту жительства или по прозвищу, данному односельчанами.

Другие, более экзотические версии (например, от тюркского имени или от слова «клинья» в значении «шалость») не выдерживают критики — ни исторических, ни лингвистических подтверждений им нет. Фамилия Клиньё — один из тех редких случаев, когда прозвище, данное по конкретному и понятному признаку (земля, ремесло), сохранилось в почти неизменной, «живой» народной форме.