Фамилия Клинник ведет начало от прозвища Клинник, котоое восходит к аналогичному нарицательному, связанному со словом «клин». Даля, клин - это «короткий брусок, снятый к одному концу на нет; гранный кусок дерева, железа, с одним толстым острым концом». Возможно, прозвище Клинник относится к профессиональным именованиям, то есть указывает на профессию предка: Клинником могли называть того, кто занимался изготовлением клинышков, колышков для различных хозяйственных нужд. Однако в старину в некоторых диалектах клинником называли пышный из-за большого числа вставок (клиньев) женский сарафан. Следовательно, Клинником могли прозвать человека, который шил сарафаны или носил одежду, фасоном напоминающую клинник. Менее вероятно, что в основе фамилии Клинник лежит нецерковное имя Клиник, данное по диалектному названию растения амарант, которое распространилось в России в XIX веке. Упоминания о представителях фамилии Клинник встречаются в некоторых Книгах памяти, из которых известно, в частности, о Федоре Андреевиче Клиннике, 1895 года рождения, который был уроженцем села Бутовка Соснецкого уезда Черниговской губернии и проживал в селе Решеты Кочковского района Новосибирской области.