Фамилия Клипеа — редкий пример, когда этимология уходит корнями не в славянские языки, а в румынский. В основе лежит прозвище Clipea, которое связывают с румынским глаголом clipi — «мигать, быстро моргать». Скорее всего, так нарекали человека с привычкой часто моргать или, в переносном смысле, невнимательного, рассеянного.

Есть и вторая версия, не менее убедительная: прозвище могли дать от румынского слова clipa — «мгновение, момент». В таком случае оно характеризовало человека быстрого, юркого, того, кто всё делает молниеносно. Какая из гипотез вернее — сказать трудно, обе укладываются в логику прозвищ по поведению.

Менее вероятное объяснение выводит фамилию из украинского слова «клипы» — «руки». Якобы так могли прозвать человека с большими или сильными руками. Но эта версия слабее: во-первых, слово «клипы» в значении «руки» — диалектное и редкое, во-вторых, фамилия пишется через «е», что ближе к румынскому написанию.

Суффикса в фамилии нет — она застыла в форме чистого прозвища. Такое оформление характерно для фамилий молдавского и румынского происхождения, где родовое имя часто совпадает с бытовым прозвищем без дополнительных русских суффиксов -ов или -ин. Географически фамилия тяготеет к зонам румынско-украинского пограничья: Бессарабия, Буковина, отчасти Молдова. Носители фамилии Клипеа — это, вероятно, потомки выходцев из этих мест, где румынская речь соседствовала с украинской.