Фамилия Клочихин — один из ярких примеров «материнских» фамилий, образованных не от имени отца, а от прозвища матери. В основе лежит прозвище Клочиха, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Клочихин», то есть сын или потомок Клочихи.

Прозвище Клочиха связано с нарицательным «клок» — кусок, пучок, вырванная часть чего-либо. Однако в русских говорах у этого корня было несколько значений, и каждое могло дать начало прозвищу. Если женщину называли Клочихой за то, что она «клочила волос» — ходила непричесанной, с торчащими прядями, — то прозвище носило внешний, бытовой характер. Если же в основе лежало выражение «клочить деньги» (мотать, сорить, тратить без толку), то за ним стояла оценка поведения: расточительная, небережливая хозяйка.

Существовал и промысловый оттенок: «клочить сома» означало ловить рыбу особым способом — на клок, приманку, издающую звук. В таком случае Клочихой могли прозвать жену рыбака или женщину, промышлявшую ловлей. Эта версия менее распространена, но её стоит учитывать, особенно если фамилия бытует в регионах с развитым рыболовством — на Волге, Дону или в Прикамье.

Сами прозвища Клок, Клочок, Клочиха известны с давних пор. В старых писцовых книгах и переписях они встречаются как нецерковные имена, нередко — у крестьян и посадских людей. Фамилия Клочихин, таким образом, закрепилась за потомками именно той женщины, которую в округе знали под этим прозвищем. По сути, это редкий случай, когда фамильное прозвание пошло не от мужчины-родоначальника, а от матери или бабки, что делает историю рода Клочихиных особенно интересной для семейного исследователя.