Фамилия Клубаков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет прозрачной связи с профессией или распространённым именем, поэтому разбирать её стоит через словообразовательную модель и возможные прозвищные корни.

Основа фамилии — «клубак». Это диалектное слово, бытовавшее в северных и центральных говорах. Клубаком называли не просто клубок ниток, а нечто сбитое, скомканное, округлое — ком снега, плотный клок шерсти, спутанный моток. В переносном смысле прозвище Клубак могли дать человеку коренастому, плотного телосложения, «круглому», или же тому, кто постоянно путался в делах, был нерасторопным, «сбитым с толку». Реже так могли назвать мастера, который прял или сматывал нити, но это менее вероятно: прозвища от орудий труда обычно образовывались иначе.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную патронимическую модель: Клубаков — сын Клубака. Фамилия закрепилась в центральных регионах России, но встречается и на Урале, куда переселенцы принесли диалектную лексику. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Клубак, что подтверждает её недворянское, простонародное происхождение.

Интересная деталь: в некоторых говорах существовал глагол «клубачить» — сбивать, мять, путать. Если предок получил прозвище от действия, то Клубаковым мог стать сын человека, который «клубачил» сено, шерсть или даже делал неаккуратную работу. Такая версия менее распространена, но лингвистически обоснована, так как отглагольные прозвища на «-ак» в русской ономастике обычны (например, Рыбак, Гуляка).

Однокоренные фамилии — Клубков, Клубочкин — встречаются чаще, но Клубаков отличается именно диалектной формой основы. Если Клубков мог произойти от уменьшительного «клубок», то Клубаков сохранил более архаичное, грубоватое звучание, характерное для деревенских прозвищ.

Сословная принадлежность у Клубаковых почти всегда крестьянская, изредка — мещанская. В дворянские роды фамилия не попала, и в гербовниках её нет. Поэтому, скорее всего, предки носителя фамилии — люди, жившие земледельческим трудом, чьё прозвище метко описывало внешность или характер.