Прозвище Книжник в старину имело несколько значений: так называли ученого человека, знающего священное писание, догматика; учителя, толкователя Закона Божия; грамотея, книжного человека, хорошо знающего грамоту; охотника, любителя книг. Однако чаще всего прозвище Книжник указывало на род занятий человека: его получал разносчик книг, букинист. Кроме того, возможно, что основатель рода Книжниковых относился к корпорации писцов, к-рые либо копировали списки книг, либо были их составителями. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Книжник, со временем получил фамилию Книжников.