Фамилия Кочубеева — женская форма фамилии Кочубеев, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужской основой. В основе лежит прозвище Кочубей, которое, скорее всего, имеет тюркские корни. Одна из самых убедительных версий возводит его к словосочетанию «kochu bej», что можно перевести как «маленький господин» или «младший князь». Вторая версия, менее популярная, но тоже имеющая право на существование, связывает прозвище с тюркским «маленький жеребенок» — в этом случае предок мог заниматься коневодством или просто получить прозвище по какой-то внешней черте.

Словообразовательная модель здесь простая: к основе Кочубей добавился патронимический суффикс -ев (вариант суффикса -ов после мягких и шипящих согласных), а окончание -а указывает на женский род. То есть Кочубеева буквально означает «дочь или жена Кочубея».

Исторический контекст фамилии необычен. Существует предание, что род Кочубеевых ведет начало от Кичи бея, который пришел в Литву в середине XIII века вместе с булгарами, спасавшимися от монгольского нашествия. По другой версии, родоначальником был Кочу Бей — ордынский выходец, перешедший на службу к великому князю литовскому Ольгерду (правил в 1345–1377 годах). Если это так, то фамилия Кочубеева восходит к очень древним пластам истории и связана с тюркской знатью, которая оказалась в среде восточнославянского населения.

В отличие от многих фамилий, образованных от крестильных имен, Кочубеева — фамилия прозвищная, и её основа напрямую указывает на социальный статус или занятие предка. В любом случае, носительница этой фамилии может смотреть на неё не просто как на набор букв, а как на метку, за которой стоит несколько веков и как минимум две культурные традиции — тюркская и славянская.