Фамилия Коконова образована от прозвища Кокон. Слово «кокон» заимствовано из французского языка и обозначает кожушек шелковичной гусеницы, в котором находится личинка. Прозвище Кокон мог получить коконщик — человек, занимавшийся размоткой коконов и изготовлением шелковых нитей. В русских говорах так могли называть и того, кто носил на себе много одежды, кутался.

Поскольку слово «кокон» — заимствование, фамилия Коконова, скорее всего, сравнительно молодая. Она возникла не раньше XVIII–XIX веков, когда французские термины начали проникать в русский быт через дворянскую культуру и промышленность. Это отличает её от фамилий на древней славянской основе.

Модель образования проста: к основе Кокон- добавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Коконов), а затем женский вариант Коконова. Встречается фамилия преимущественно в южных и центральных регионах России, где было развито шелководство, а также на Урале. Мужской вариант — Коконов — фиксируется в документах с XIX века.

Таким образом, фамилия Коконова хранит память о конкретном занятии предка: скорее всего, он был мастером по обработке шелка или получил прозвище за привычку одеваться во множество слоёв. В любом случае, прозвище Кокон закрепилось за человеком как наиболее употребительное именование, а со временем легло в основу фамилии.