Фамилия Коконов образована от прозвища Кокон, которое восходит к французскому слову «cocon». В русском языке «кокон» — это оболочка, в которую шелковичная гусеница превращается в куколку. Прозвище Кокон мог получить человек, занимавшийся размоткой коконов и изготовлением шелковых нитей — коконщик. Такое ремесло было редким и требовало особых навыков, поэтому прозвище цепко держалось за мастера. Однако есть и другая версия: в быту «коконом» в шутку называли человека, который кутался в несколько слоёв одежды, словно личинка в защитную оболочку. Оба варианта возможны, но первый — с профессиональным уклоном — выглядит убедительнее, поскольку даёт конкретный социальный контекст.

Поскольку слово «кокон» заимствовано, фамилия Коконов сравнительно молодая: она не могла возникнуть раньше, чем само слово вошло в обиход. Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель: так образовывали фамилии от прозвищ и профессий, отвечая на вопрос «чей?» — то есть сын Кокона. Интересно, что в отличие от распространённых фамилий вроде Кузнецов или Плотников, Коконовы встречаются редко и имеют узкую географию: чаще всего их можно встретить в регионах, где исторически развивалось шелководство, например, в Средней Азии и на юге России. Это не случайно — там ремесло коконщика было востребовано.

Прозвище Кокон закрепилось за человеком как наиболее употребительное именование, а со временем легло в основу фамилии. Потомок человека с таким прозвищем и получил фамилию Коконов.