Фамилия Кокшенёв — редкий пример того, как одно слово может вести сразу в несколько разных эпох и языков. Самое прямое объяснение лежит в русских северных говорах: глагол «кокшить» означал «бить, колотить». Прозвище Кокшень, от которого образована фамилия, могли дать человеку вспыльчивому, драчливому или просто резкому в движениях. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного) указывает на стандартную модель русских фамилий: «чей?» — «Кокшенев», то есть сын или потомок Кокшеня.

Но это только одна версия. Дело в том, что «кокша» — известный гидроним на Русском Севере: есть река Кокшеньга в Вологодской и Архангельской областях, а топоним Кокшеньга дал название целому региону — Кокшеньгской волости. В таком случае прозвище Кокшень могло быть не по характеру, а по месту жительства: человек, пришедший с Кокшеньги или живший на её берегу. Фамилия Кокшенёв могла закрепиться именно в этой местности — вологодские и архангельские корни для неё самые вероятные.

Есть и третья линия, тюркская. У татар, башкир и чувашей имя Кокша (или Күкшә) переводится как «голубоватый», «сивый», а в переносном смысле — «голубоглазый». Если предок носителя фамилии был из поволжских народов, прозвище могло указывать на цвет глаз. Однако в русской среде это имя, скорее всего, переосмыслили как прозвище, и фамилия пошла уже по славянской словообразовательной модели.

Словообразовательный разбор прост: основа Кокшен- (от Кокшень с беглым е) плюс суффикс принадлежности -ев. Ударение в фамилии падает на последний слог — Кокшенёв, что характерно для фамилий, образованных от прозвищ с суффиксом -ень (сравните: Кислень → Кисленёв, Чернень → Черненёв). Эта акцентная модель — дополнительный аргумент в пользу исконно русского, а не заимствованного происхождения фамилии.

Итак, перед нами случай, когда три разных корня — диалектный глагол «кокшить», река Кокшеньга и тюркское имя Кокша — могли независимо друг от друга привести к одной и той же фамилии. Самый надёжный способ узнать, какой вариант верен для конкретной семьи, — проверить, откуда родом предки: если из Вологодской или Архангельской области, скорее всего, это местная топонимическая фамилия; если из центральной России — вероятнее прозвище по характеру; если из Поволжья — не исключено тюркское влияние.