Фамилия Колчерина — женская форма, а её мужской вариант, Колчерин, образован по продуктивной модели с суффиксом -ин. Этот суффикс в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Колчерин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Колчера. Основа фамилии — слово «колчер» или «колчера», и здесь мы сталкиваемся с неочевидным корнем, который требует разбора.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «колчить» или «колчерить», который в ряде говоров означал «хромать», «ковылять», «идти вперевалку». Прозвище Колчера могли дать человеку с заметной хромотой или необычной походкой. Это типичная для русской ономастики ситуация: физический недостаток или особенность становились основой для прозвища, которое затем закреплялось как фамилия. Подобные примеры — фамилии Хромов, Косолапов, Шатунов.

Менее распространённая, но возможная гипотеза отсылает к слову «колчедан» — сернистому минералу, который в народе иногда называли «колчером». Однако эта версия слабее: прозвища от названий минералов встречаются редко, а в основе фамилии стоит именно личное прозвище, а не название предмета. Кроме того, в говорах встречается слово «колчера» в значении «глухой, захолустный угол» или «овраг», но и здесь связь с прозвищем человека менее прямая.

Географически фамилия Колчерин (и Колчерина) встречается в центральных и южных областях России, особенно в бывших Рязанской и Тамбовской губерниях, где диалектные формы глагола «колчить» были в ходу. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении прозвища. Суффикс -ин указывает на то, что предки носителя фамилии были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми, а не дворянами — дворянские фамилии чаще оформлялись суффиксами -ов/-ев или -ский.

Таким образом, Колчерина — это фамилия, которая буквально рассказывает о предке: его звали или дразнили Колчера за хромоту или особенную походку. В ней нет загадочного благородного корня, зато есть живая бытовая деталь, характерная для русской антропонимии.